Et si vous aviez la possibilité de retrouver toutes les ressources nécessaires de faire de votre projet de recherche, un réel succès ? C’est désormais possible avec la « bibliothèque IMS », qui met à disposition 578 composés divers en stock et prêts à être ciblés !
La bibliothèque IMS, c’est quoi exactement ?
Véritable collection de composés chimiques conçue pour être utilisée en recherche pharmaceutique, la chimiothèque de l’IMS devient un outil indispensable lors des premières étapes de la découverte de médicaments.
Elle se compose d’ailleurs de deux sous-bibliothèques :
- EIMS : cette bibliothèque comprend 578 composés divers qui sont déjà en stock et prêts à être criblés. Ces composés ont été sélectionnés pour leur diversité chimique et leur disponibilité immédiate pour les tests. De plus, la chimiothèque physique va prochainement être criblée sur le récepteur GalanineR2 (de la famille des récepteurs couplés aux protéines G) en collaboration avec Frédéric Simonin afin d’identifier de nouveaux ligands brevetables de ce récepteur et développer de potentiels candidats médicaments dans les domaines de la douleur et des maladies métaboliques. Ce projet sera réalisé dans le cadre des projets financés par l’IMS !
- VIMS : il s’agit ici d’une bibliothèque virtuelle qui contient de nouveaux composés conçus par des chimistes et leur potentiel à étendre la diversité pharmacophorique. Cette bibliothèque virtuelle offre une gamme plus large de motifs de liaison et présente des caractéristiques améliorées de type médicament grâce à l’ajout de divers groupes fonctionnels aux échafaudages présents dans la bibliothèque Eims. Elle inclut également un processus de filtrage pour éliminer les structures réactives ou inhabituelles.
Ces deux bibliothèques ont été créées pour répondre aux besoins spécifiques des projets de recherche universitaires en termes de coût et d’efficacité des ressources. Elles tirent parti de l’expertise des chimistes organiques et des outils de chimio-informatique pour maximiser les chances de succès dans la découverte de nouveaux médicaments.
Échanges avec les chercheurs
Afin de comprendre au mieux ce nouveau projet plus que prometteur, nous avons eu l’occasion d’échanger avec trois équipes de chimie, portées par Dominique BONNET, Esther KELLENBERGER et Frédéric BIHEL.
Comment cette idée est-elle née et quels étaient les principaux objectifs ?
L’idée de la bibliothèque IMS est née d’une discussion entre collègues désireux de travailler ensemble, en synergie en en utilisant une méthodologie commune maîtrisée.
Les principaux objectifs étaient de valoriser le savoir-faire des équipes de chimistes informatiques et synthétiques pour faire bénéficier leurs projets de chimie médicinale et, plus largement, la découverte et l’optimisation de molécules bioactives.
Quels secteurs ou domaines de recherche pourraient le plus bénéficier de cette bibliothèque ?
Les secteurs ou domaines de recherche qui pourraient le plus bénéficier de la bibliothèque IMS sont :
- La santé humaine ou animale : elle peut aider à la découverte de nouvelles molécules ayant un potentiel thérapeutique, être utilisée pour le diagnostic, ou servir dans des recherches fondamentales et appliquées.
- La recherche fondamentale : elle permet la découverte de nouveaux outils chimiques pour étudier le vivant, offrant ainsi des ressources précieuses pour mieux comprendre les mécanismes biologiques.
Comment envisagez-vous l’évolution de la bibliothèque pour répondre aux besoins futurs de la recherche en chimie et en pharmacologie ?
Pour répondre aux besoins futurs de la recherche en chimie et pharmacologie, nous envisageons l’évolution de la bibliothèque IMS de la manière suivante :
- Suivi des criblages : identifier les molécules polyvalentes, c’est-à-dire celles qui interagissent avec plusieurs cibles biologiques, ainsi que les molécules qui ne montrent aucune activité dans les tests.
- Enrichissement de la chimiothèque : ajouter de nouvelles molécules originales synthétisées dans l’un des trois laboratoires participants, augmentant ainsi la diversité et le potentiel de la bibliothèque.
- Prédiction de l’accessibilité synthétique : travailler sur la prédiction de la faisabilité synthétique des molécules générées par l’approche informatique, assurant que les nouvelles molécules virtuelles peuvent être réellement fabriquées en laboratoire.
Comment les chercheurs externes peuvent-ils accéder à la librairie de l’IMS ? Est-ce qu’il y a des conditions ou des critères spécifiques ?
Non, la librairie est également ouverte pour des projets collaboratifs !
Quels types de collaborations ou de partenariats espérez-vous développer à travers ce projet ?
La librairie de l’IMS a d’abord été conçue pour servir les projets de ses concepteurs ainsi que de ceux de ses partenaires.